Pengurus Yayasan dan Masyarakat umum perlu mengetahui konsep tujuan berdirinya yayasan, agar mereka bisa memahami bahwa sebuah Yayasan memiliki kejelasan cita-cita atau tujuan utama di masa kini dan masa depan.
Pemikiran yang sangat mendalam dari Para Pendiri Yayasan, prinsip-prinsip dan nilai-nilai berharga untuk membangun dan mengembangkan organisasi yang berorientasi di masa depan itu akan dituangkan ke dalam Visi Yayasan.
Di dalam Misi Yayasan terdapat perencanaan, strategi dan tindakkan langkah kerja nyata yang berorientasi pada masa kini, sehingga bisa mewujudkan cita-cita Yayasan dalam mencapai Visinya.
Berikut Visi & Misi Yayasan Pendidikan Islam Al Atsari:
Visi
1. Menjadi sarana tersebarnya dakwah ahlussunnah di Indonesia, khususnya di masyarakat Yogyakarta
2. Menjadi pusat pendidikan belajar agama Islam yang benar, baik dari sisi bahasa Arab, tahsin, dan ilmu diniyyah
3. Menyelenggarakan pendidikan formal islami unggulan di tingkat Dasar, Menengah, dan Atas di Provinsi DI Yogyakarta
4. Menjadi pusat dan rujukan pembinaan dan dakwah untuk mahasiswa di Provinsi DI Yogyakarta
Misi
1. Mengadakan kajian rutin ilmiah mingguan dan bulanan yang membahas dasar-dasar keislaman dengan mengundang ustaz-ustaz yang berkompeten
2. Mengembangkan dakwah sunah di media elektronik maupun cetak dengan konten berkualitas yang terarah dan terukur
3. Mengembangkan program pendidikan bahasa Arab, bimbingan membaca dan menghafal Alquran, serta program studi Islam secara terstruktur yang memiliki standar mutu yang baik
4. Mengembangkan pembinaan mahasiswa penghuni wisma muslim sebagai pusat pengkaderan calon penggerak dakwah dari kalangan mahasiswa
5. Mengembangkan lembaga dakwah mahasiswa yang dapat menjaring komunikasi dan kerja sama dakwah antar kampus di wilayah Yogyakarta
6. Mengembangkan sekolah dasar islam terpadu yang berkualitas dengan berdasarkan akidah dan manhaj ahlussunnah wal jamaah
7. Mengembangkan program dakwah masyarakat untuk berbagai lapisan, dari kalangan bapak-bapak, ibu-ibu, remaja, dan anak-anak